羊肉串以风味独特、购买方便而日渐受到消费者的青睐。但是，消费者尚不了解常吃烤羊肉串对个人健康的危害和对环境的污染。
烤羊肉串大多是在煤火或木炭上熏烤，除了会直接粘上碳粒外，煤炭中还含有氮氧化物、硫化物、氟化物、砷、多环芳烃以及世界公认的强致癌物——3－4苯并芘等多种有害物质。它们可以附着在食物表面，也可以深入到食物内部。尤其当羊肉难免烧焦时，焦化的蛋白质也会对人体造成伤害。经常进食焦化的蛋白质有可能诱发癌症。有人做过一个科学试验：用谷氨酸（蛋白质中的一种氨基酸）的焦化物，以相当的比例混入饲料喂养小白鼠，两年后便诱发出了肝癌、肠癌和脑瘤。在42只雄性小白鼠中，肝癌的发生率为83％，肠癌的发生率为50％；42只雌性小白鼠中，肝癌的发生率为57％，肠癌为20％，脑瘤为13％。这些数字足以证实直接或间接在煤炭或木炭上熏烤的食品危害之大了。
烤羊肉串常发生表面焦脆而当中半生不熟的现象，这样极易感染寄生虫病或造成沙门氏菌等食物中毒。此外，街头闹市制作的羊肉串肯定会吸附尘埃灰土。更何况，当小贩采用的羊肉不新鲜，甚至是腐败变质的，则可能造成更严重的肉毒素中毒。烤羊肉串一般采用燃烧煤炭，所产生的烟雾、一氧化碳、二氧化碳等有害气体，加重了城市空气的污染，间接致癌。
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